1968年3月2日深夜,刘善本被专案组抄了家,押到空军学院办公大楼西头二层的一个套间里进行审讯。在被折磨了几天后,刘善本于3月10日死去,终年53岁。不知临死那一刻,他是否明白,自己当初相信的不过是中共画出的民主大饼,自己的选择真的错了。