从那时起，康生就一直参与中央有关对苏方针政策的决策，参加中共与苏共之间所有的会谈。特别是中苏公开论战后的“反修”文章、文件的起草，都是在康生参与下进行的。1968年，康生如愿以偿，取代周恩来，实际上主管了中央调查部的工作。有关调查部的业务、运动、干部任免等重大问题都必须向他请示汇报。
